SYNCED è ambientato in un futuro prossimo del nostro mondo, dove la nanotecnologia è diventata la spina dorsale della civiltà. Dopo una catastrofe nota come il Crollo, le nanomacchine si sono rivoltate contro i loro creatori. Consumano gli esseri umani per riprodursi e si trasformano nei letali nano. In questa apocalisse, i giocatori assumono il ruolo di un Runner, un coraggioso soldato di ventura che setaccia il Meridiano alla ricerca della preziosa sostanza nano-energetica Nerva.

SYNCED aggiunge un tocco innovativo al genere degli sparatutto cooperativi: i Runner non solo si uniscono in squadre di tre persone, ma possono anche sincronizzarsi con i Prime Nano sconfitti e trasformarli in Companion Nano. Si tratta di una risorsa aggiuntiva che può essere utilizzata strategicamente nelle frenetiche battaglie PvE e PvP del gioco.

SYNCED aggiunge anche elementi dei classici sparatutto looter: i corridori possono acquisire risorse nelle battaglie PvE e PvP per potenziare il proprio personaggio. Allo stesso tempo, sbloccano armi più potenti e mod che si adattano meglio al loro stile di gioco.